دانشجوی نمونه  سینا ملاح

پروتئین ها و ژنوم HIV موضوع تحقیق بزرگی از وقتی که ویروس در سال 1983 کشف شد بوده است.تا 2 سال بعد از اولین مورد عمده AIDS همراه با بیماری که در سال 1981 گزارش شده بود کشف شد.

ساختار:

HIVدر ساختار از بقیه retro virus  ها متمایز است.در حدود 120 nm ضخامت دارد (حدود 60 برابر کوچک تر از یک سلول قرمز خون)و حالت گوی مانند زبر است.

1HIV-  از دو نسخه RNA تکی به هم بافته محصور شده به وسیله یک کپسید مخروطی که 24pr- ویروسی نوعی از lenti  ویروس ها را در بر می گیرد تشکیل شده است.

ترکیب RNA 9749 نوکلئوتید طول دارد.RNA  به وسیله غشاء پلاسمایی منشاء گرفته از میزبان احاطه شده است.

تک رشته RNA محکم به پروتئین های نوکلئوکپسید که برای تکامل virion  ضروری هستند مثل transcript وارونه و integrase  چسبیده است.

نوکلئو کپسید(p6 و p7) با RNA ژنومی همراه هستند(یک مولکول در هر هگزا متر)و RNA را محا فظت می کنند از هضم به وسیله نوکلئاز.یک ترکیب ماتریکس از یک تجمع از پروتئین ویروسی PIV کپسید را احاطه می کند که بی نقصی ذره ویروس را تضمین می کند.

به علاوه محصور شده در ذره ویروس vif و vpr و Nef  و p7 و پروتئاز ویروسی هستند.پوشش زمانی تشکیل می شود ک کپسید از سلول میزبان طوری جوانه بزند که برخی از غشاء سلول میزبان را با خود بگیرد.غشاء گلیکو پروتئین gp120 و gp41 را در بر می گیرد.در نتیجه نقش اش در ضمائم سلول ویروس ساختار پوشش ویروس که میخی مانند است مرکب می شود از gp 120  و gp 41  اهمیت ویژه ای دارد.

امید می رود که ساختار میخی شکل پوشش با همکاری معلومات علمی ویروس و سیکل دفاعی آن تعیین شود و کمکی در ایجاد شفاء گردد.

اولین مدل ساختار آن در سال 2006 با استفاده از cryoelection microscopy  گرد آوری شد و پیشنهاد شد که سه نسخه heterodiner  از gp120 و gp41 که عقیده می رود تا به صورت سه جزئی به عنوان پوشش میخی تشکیل شود.

اما اندکی بعد یک مدل پایه قارچی سردار ثابت شد.که شامل یک سه جزئی از gp130 با یک گلیکوپروتئین gp41 تکی که آن را به غشاء محکم می کرد.

احتمالات مختلفی در مورد منشاء این تفاوت وجود دارد.به طوریکه ویروس های تصویر شده با دو گروه از نظر ساختاری متفاوت باشند.اواخر شواهد بیشتری پیدا شده است که مدل hetro trimer  را تایید می کند.

Genume Organization:

HIV ژن های کد شده متعددی برای پروتئین های ساختاری دارد که در تمام hetro virus  ها شناخته شده و ژن های بدون ساختار متعدد(فرعی) که در HIV منحصر به فرد اند.ژن gag زیر بنای اصلی ویروس را آماده می کند.ژن pol مکانیسم اصلی ای را که retri virus ها تکثیر می شوند را آماده می کند وقتی که بقیه کمک می کنند تا HIV وارد سلول میزبان شود و تکثیر اش را افزایش دهد.

به هر حال آن ها ممکن است با جهش تغییر یابند.تمامی این ژن ها به جزء tev در تمامی انواع HIV وجود دارند.تنوع ژنتیکی HIV را ببینید.

Gag (آنتی ژن گروه خاص):کدهایی برای پلی پروتئین های gag که در طی بوجود آمدن MA(پروتئین ماتریکسp17)CA(پروتئین کپسید p24)SP1(spacer peptide1,p2)NA(پروتئین نوکلئوکپسیدp7)SP2 و p6پردازش می شود.

Pol:کدهایی برای آنزیم های transcriptase وارونه, integrase  وHIV protease.

Env:کدهایی برای gp160 و منشائی برای gp120 و gp41 .

پروتئین های جا سازی شده در غشاء ویروس که ویروس را برای چسبیدن و ترکیب شدن با سلول های هدف قادر می سازد.

فعال کننده های انتقالیtat,rev,vpr  

تنظیم کننده های دیگر     vif,nef,vpu  

Tev:این ژن فقط در تعداد کمی از ایزوله های HIV-1 وجود دارد.

Tev ترکیبی از بخش هایی از ژن های tat,env  و کدهایی برای یک پروتئین برخی از خصوصیات tat است.ولی با کمی از خصوصیات rev  یا بدون آن خصوصیات.